房贷逾期三个月但是都还上了，现在还是正常扣款，但是银行还是让把剩下的全不还清

银行在房贷合同中通常有权在借款人逾期后要求提前还款。但从法律角度看，银行需遵循合同约定，并考虑借款人已及时还清逾期款项的实际情况。是否合理需具体分析合同条款及当地法律法规。
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首先，检查房贷合同，了解相关条款。若合同中有类似规定，与银行协商分期还款或延长贷款期限。若无此类规定，可提出异议，并保留证据以备法律诉讼。同时，确保继续按时还款，避免进一步逾期。
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除了与银行协商，还可以考虑寻求法律援助或咨询律师，了解个人权益及可能的法律救济途径。根据不同情况，处理方式包括协商、调解、诉讼等。选择最适合你的方式，维护自身合法权益。